Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2afxP27661 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
H2afxP27661 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
H2afxP27661 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2afxP27661 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2afxP27661 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
H2afxP27661 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2afxP27661 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2afxP27661 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2afxP27661 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2afxP27661 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2afxP27661 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms