Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PdgfraP26618 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms