Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkchP23298 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkchP23298 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkchP23298 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkchP23298 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkchP23298 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrkchP23298 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PrkchP23298 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PrkchP23298 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PrkchP23298 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrkchP23298 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkchP23298 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkchP23298 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkchP23298 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkchP23298 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkchP23298 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkchP23298 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkchP23298 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkchP23298 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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