Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NefhP19246 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NefhP19246 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NefhP19246 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NefhP19246 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NefhP19246 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NefhP19246 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NefhP19246 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NefhP19246 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NefhP19246 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NefhP19246 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NefhP19246 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NefhP19246 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NefhP19246 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NefhP19246 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NefhP19246 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NefhP19246 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NefhP19246 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NefhP19246 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NefhP19246 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NefhP19246 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NefhP19246 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NefhP19246 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NefhP19246 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NefhP19246 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NefhP19246 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NefhP19246 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NefhP19246 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NefhP19246 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NefhP19246 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NefhP19246 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NefhP19246 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NefhP19246 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NefhP19246 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NefhP19246 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NefhP19246 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NefhP19246 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NefhP19246 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NefhP19246 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NefhP19246 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NefhP19246 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NefhP19246 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NefhP19246 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NefhP19246 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NefhP19246 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NefhP19246 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NefhP19246 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NefhP19246 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NefhP19246 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NefhP19246 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NefhP19246 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NefhP19246 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NefhP19246 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NefhP19246 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NefhP19246 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NefhP19246 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NefhP19246 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NefhP19246 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NefhP19246 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NefhP19246 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NefhP19246 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NefhP19246 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NefhP19246 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NefhP19246 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NefhP19246 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NefhP19246 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NefhP19246 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NefhP19246 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NefhP19246 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NefhP19246 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NefhP19246 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NefhP19246 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NefhP19246 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NefhP19246 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NefhP19246 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NefhP19246 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NefhP19246 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NefhP19246 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NefhP19246 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NefhP19246 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NefhP19246 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NefhP19246 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NefhP19246 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NefhP19246 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NefhP19246 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NefhP19246 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NefhP19246 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NefhP19246 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NefhP19246 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NefhP19246 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NefhP19246 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NefhP19246 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NefhP19246 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NefhP19246 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NefhP19246 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NefhP19246 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NefhP19246 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NefhP19246 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NefhP19246 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NefhP19246 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms