Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RargP18911 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RargP18911 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RargP18911 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RargP18911 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RargP18911 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RargP18911 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RargP18911 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RargP18911 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RargP18911 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RargP18911 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RargP18911 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RargP18911 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RargP18911 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RargP18911 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RargP18911 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RargP18911 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RargP18911 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RargP18911 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RargP18911 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RargP18911 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RargP18911 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RargP18911 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RargP18911 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RargP18911 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RargP18911 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RargP18911 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RargP18911 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RargP18911 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RargP18911 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RargP18911 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RargP18911 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RargP18911 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RargP18911 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RargP18911 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RargP18911 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RargP18911 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RargP18911 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RargP18911 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RargP18911 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RargP18911 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RargP18911 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RargP18911 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RargP18911 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RargP18911 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RargP18911 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RargP18911 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RargP18911 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RargP18911 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RargP18911 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RargP18911 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RargP18911 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RargP18911 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RargP18911 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RargP18911 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RargP18911 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RargP18911 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
RargP18911 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RargP18911 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RargP18911 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RargP18911 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RargP18911 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RargP18911 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RargP18911 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RargP18911 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RargP18911 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RargP18911 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RargP18911 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RargP18911 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RargP18911 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RargP18911 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RargP18911 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RargP18911 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RargP18911 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RargP18911 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RargP18911 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RargP18911 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RargP18911 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RargP18911 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RargP18911 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RargP18911 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RargP18911 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RargP18911 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RargP18911 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RargP18911 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RargP18911 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RargP18911 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RargP18911 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RargP18911 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RargP18911 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RargP18911 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RargP18911 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RargP18911 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RargP18911 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RargP18911 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RargP18911 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RargP18911 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RargP18911 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RargP18911 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RargP18911 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms