Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa-rs1P17533 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa-rs1P17533 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa-rs1P17533 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa-rs1P17533 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa-rs1P17533 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa-rs1P17533 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa-rs1P17533 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa-rs1P17533 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa-rs1P17533 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa-rs1P17533 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa-rs1P17533 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Defa-rs1P17533 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Defa-rs1P17533 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa-rs1P17533 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms