Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pou4f1P17208 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou4f1P17208 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms