Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp53P15975 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp53P15975 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp53P15975 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp53P15975 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp53P15975 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp53P15975 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp53P15975 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp53P15975 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp53P15975 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp53P15975 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp53P15975 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp53P15975 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp53P15975 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp53P15975 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp53P15975 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp53P15975 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp53P15975 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp53P15975 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp53P15975 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp53P15975 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp53P15975 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp53P15975 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp53P15975 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp53P15975 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp53P15975 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp53P15975 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp53P15975 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp53P15975 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp53P15975 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp53P15975 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp53P15975 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp53P15975 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp53P15975 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp53P15975 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp53P15975 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp53P15975 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp53P15975 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp53P15975 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp53P15975 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp53P15975 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp53P15975 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp53P15975 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp53P15975 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp53P15975 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp53P15975 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp53P15975 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp53P15975 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp53P15975 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp53P15975 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp53P15975 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp53P15975 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp53P15975 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp53P15975 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp53P15975 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp53P15975 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp53P15975 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp53P15975 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms