Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd44P15379 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd44P15379 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd44P15379 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd44P15379 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd44P15379 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd44P15379 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd44P15379 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd44P15379 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd44P15379 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms