Protein–RNA interactions for Protein: P14427

H2-D1, H-2 class I histocompatibility antigen, D-P alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-D1P14427 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-D1P14427 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-D1P14427 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms