Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Calb1P12658 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Calb1P12658 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Calb1P12658 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Calb1P12658 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Calb1P12658 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Calb1P12658 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Calb1P12658 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Calb1P12658 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Calb1P12658 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms