Protein–RNA interactions for Protein: P11378

Tnp2, Nuclear transition protein 2, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp2P11378 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnp2P11378 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tnp2P11378 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tnp2P11378 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tnp2P11378 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tnp2P11378 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tnp2P11378 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnp2P11378 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnp2P11378 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnp2P11378 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnp2P11378 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnp2P11378 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnp2P11378 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnp2P11378 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnp2P11378 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnp2P11378 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnp2P11378 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnp2P11378 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnp2P11378 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnp2P11378 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnp2P11378 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnp2P11378 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnp2P11378 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnp2P11378 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnp2P11378 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnp2P11378 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnp2P11378 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnp2P11378 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnp2P11378 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnp2P11378 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnp2P11378 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnp2P11378 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnp2P11378 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnp2P11378 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnp2P11378 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnp2P11378 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnp2P11378 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnp2P11378 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnp2P11378 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnp2P11378 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnp2P11378 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnp2P11378 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnp2P11378 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnp2P11378 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnp2P11378 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnp2P11378 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnp2P11378 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnp2P11378 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnp2P11378 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnp2P11378 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnp2P11378 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnp2P11378 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnp2P11378 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnp2P11378 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnp2P11378 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnp2P11378 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnp2P11378 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnp2P11378 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnp2P11378 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnp2P11378 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnp2P11378 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnp2P11378 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnp2P11378 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnp2P11378 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnp2P11378 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnp2P11378 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnp2P11378 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnp2P11378 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnp2P11378 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnp2P11378 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnp2P11378 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnp2P11378 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnp2P11378 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnp2P11378 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnp2P11378 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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