Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P10404 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P10404 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P10404 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
P10404 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P10404 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
P10404 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
P10404 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
P10404 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P10404 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
P10404 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P10404 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P10404 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P10404 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
P10404 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P10404 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P10404 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P10404 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P10404 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P10404 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P10404 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
P10404 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P10404 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P10404 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P10404 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P10404 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
P10404 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P10404 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P10404 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
P10404 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P10404 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P10404 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P10404 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P10404 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
P10404 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P10404 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P10404 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
P10404 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
P10404 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P10404 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P10404 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P10404 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P10404 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P10404 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P10404 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P10404 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P10404 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
P10404 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P10404 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
P10404 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P10404 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
P10404 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P10404 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
P10404 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
P10404 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
P10404 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
P10404 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
P10404 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
P10404 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P10404 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
P10404 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P10404 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P10404 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P10404 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P10404 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P10404 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P10404 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
P10404 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P10404 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P10404 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
P10404 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P10404 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P10404 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
P10404 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P10404 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
P10404 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
P10404 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P10404 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P10404 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P10404 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P10404 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P10404 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P10404 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P10404 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P10404 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P10404 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P10404 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P10404 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P10404 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P10404 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P10404 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
P10404 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
P10404 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P10404 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P10404 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P10404 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P10404 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P10404 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P10404 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P10404 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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