Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Schip1P0DPB4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Schip1P0DPB4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms