Protein–RNA interactions for Protein: P0C872

Jmjd7, JmjC domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd7P0C872 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Jmjd7P0C872 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Jmjd7P0C872 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms