Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb1P09055 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb1P09055 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms