Protein–RNA interactions for Protein: P05555

Itgam, Integrin alpha-M, mousemouse

Predictions only

Length 1,153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgamP05555 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ItgamP05555 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ItgamP05555 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgamP05555 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ItgamP05555 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ItgamP05555 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ItgamP05555 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ItgamP05555 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ItgamP05555 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ItgamP05555 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ItgamP05555 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ItgamP05555 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ItgamP05555 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms