Protein–RNA interactions for Protein: P01822

Ig heavy chain V region MOPC 315, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01822 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01822 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01822 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01822 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01822 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01822 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01822 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01822 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
P01822 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
P01822 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01822 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01822 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01822 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01822 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01822 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01822 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01822 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01822 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01822 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01822 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01822 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01822 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01822 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
P01822 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01822 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01822 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01822 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01822 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01822 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01822 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01822 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01822 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01822 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P01822 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01822 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01822 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01822 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01822 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01822 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P01822 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01822 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01822 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01822 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01822 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01822 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01822 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01822 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01822 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01822 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01822 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01822 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01822 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01822 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
P01822 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01822 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01822 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01822 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01822 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01822 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01822 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01822 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01822 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01822 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01822 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01822 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01822 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01822 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01822 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01822 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01822 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01822 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01822 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01822 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01822 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01822 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01822 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P01822 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01822 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01822 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01822 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01822 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01822 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01822 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01822 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01822 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01822 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P01822 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01822 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P01822 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01822 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01822 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01822 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01822 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01822 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01822 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01822 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01822 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01822 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01822 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01822 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms