Protein–RNA interactions for Protein: P01746

Ig heavy chain V region 93G7, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01746 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01746 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01746 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01746 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01746 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01746 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01746 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01746 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01746 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01746 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01746 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01746 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01746 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01746 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01746 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01746 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01746 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01746 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P01746 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01746 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P01746 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01746 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01746 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P01746 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01746 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01746 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01746 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01746 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01746 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01746 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P01746 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01746 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01746 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01746 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01746 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01746 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01746 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01746 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01746 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01746 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01746 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01746 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01746 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01746 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01746 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01746 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01746 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01746 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01746 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01746 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01746 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01746 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01746 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01746 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01746 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01746 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01746 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01746 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01746 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01746 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01746 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01746 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01746 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01746 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01746 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01746 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01746 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01746 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01746 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01746 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01746 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01746 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01746 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01746 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01746 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01746 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01746 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01746 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01746 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01746 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01746 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01746 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01746 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01746 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01746 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01746 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01746 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01746 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01746 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01746 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01746 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01746 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01746 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01746 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01746 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01746 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01746 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01746 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01746 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01746 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms