Protein–RNA interactions for Protein: P01740

T-cell receptor gamma chain V region V108A, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01740 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
P01740 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
P01740 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01740 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01740 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01740 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01740 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01740 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01740 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01740 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01740 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01740 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01740 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01740 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
P01740 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
P01740 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01740 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01740 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01740 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01740 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01740 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01740 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01740 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01740 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01740 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01740 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01740 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01740 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01740 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01740 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
P01740 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01740 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01740 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01740 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01740 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01740 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01740 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
P01740 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01740 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01740 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01740 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01740 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01740 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01740 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01740 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01740 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01740 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01740 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01740 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01740 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01740 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01740 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01740 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01740 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01740 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01740 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01740 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01740 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01740 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01740 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01740 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01740 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01740 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01740 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01740 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01740 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01740 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
P01740 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01740 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01740 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01740 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01740 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01740 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01740 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01740 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01740 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01740 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01740 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01740 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01740 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01740 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01740 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01740 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01740 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01740 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
P01740 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
P01740 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01740 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
P01740 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01740 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01740 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01740 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01740 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01740 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01740 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01740 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01740 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01740 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01740 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01740 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms