Protein–RNA interactions for Protein: P01635

Ig kappa chain V-V region K2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01635 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01635 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01635 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01635 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01635 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01635 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01635 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01635 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01635 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01635 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01635 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01635 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01635 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01635 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01635 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01635 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01635 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01635 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01635 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01635 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01635 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01635 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01635 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01635 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01635 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01635 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01635 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01635 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01635 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01635 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01635 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01635 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01635 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01635 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01635 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01635 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01635 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01635 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01635 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01635 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01635 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01635 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01635 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01635 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01635 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01635 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01635 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01635 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01635 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01635 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01635 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01635 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01635 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01635 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01635 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01635 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
P01635 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01635 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01635 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01635 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01635 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01635 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01635 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01635 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01635 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01635 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01635 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01635 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01635 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01635 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01635 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01635 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01635 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01635 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01635 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01635 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01635 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01635 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01635 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01635 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01635 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01635 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01635 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01635 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01635 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01635 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01635 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01635 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01635 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01635 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01635 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01635 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01635 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01635 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01635 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01635 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01635 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01635 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01635 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01635 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms