Protein–RNA interactions for Protein: P00493

Hprt1, Hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hprt1P00493 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hprt1P00493 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms