Protein–RNA interactions for Protein: O88875

Cd160, CD160 antigen, mousemouse

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd160O88875 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd160O88875 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd160O88875 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd160O88875 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd160O88875 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd160O88875 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd160O88875 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd160O88875 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd160O88875 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd160O88875 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd160O88875 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd160O88875 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd160O88875 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd160O88875 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd160O88875 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd160O88875 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd160O88875 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd160O88875 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd160O88875 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd160O88875 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd160O88875 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd160O88875 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cd160O88875 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cd160O88875 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cd160O88875 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cd160O88875 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd160O88875 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd160O88875 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd160O88875 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd160O88875 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd160O88875 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd160O88875 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd160O88875 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd160O88875 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd160O88875 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd160O88875 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd160O88875 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd160O88875 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd160O88875 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd160O88875 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd160O88875 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd160O88875 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd160O88875 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd160O88875 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd160O88875 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd160O88875 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd160O88875 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd160O88875 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd160O88875 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd160O88875 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd160O88875 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd160O88875 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd160O88875 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd160O88875 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd160O88875 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd160O88875 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd160O88875 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd160O88875 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd160O88875 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd160O88875 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd160O88875 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd160O88875 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd160O88875 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd160O88875 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd160O88875 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd160O88875 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd160O88875 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd160O88875 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd160O88875 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd160O88875 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd160O88875 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd160O88875 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd160O88875 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd160O88875 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd160O88875 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd160O88875 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd160O88875 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd160O88875 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd160O88875 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd160O88875 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd160O88875 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd160O88875 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd160O88875 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd160O88875 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd160O88875 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd160O88875 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd160O88875 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd160O88875 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd160O88875 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd160O88875 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd160O88875 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd160O88875 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd160O88875 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd160O88875 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd160O88875 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd160O88875 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd160O88875 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd160O88875 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd160O88875 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd160O88875 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms