Protein–RNA interactions for Protein: O88838

Spsb2, SPRY domain-containing SOCS box protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb2O88838 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spsb2O88838 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms