Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cfdp1O88271 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cfdp1O88271 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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