Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vamp4O70480 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vamp4O70480 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms