Protein–RNA interactions for Protein: O70137

Alx3, Homeobox protein aristaless-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alx3O70137 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Alx3O70137 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Alx3O70137 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Alx3O70137 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Alx3O70137 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Alx3O70137 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Alx3O70137 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Alx3O70137 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Alx3O70137 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Alx3O70137 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Alx3O70137 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Alx3O70137 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Alx3O70137 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Alx3O70137 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Alx3O70137 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Alx3O70137 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Alx3O70137 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Alx3O70137 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Alx3O70137 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Alx3O70137 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Alx3O70137 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Alx3O70137 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Alx3O70137 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Alx3O70137 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Alx3O70137 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alx3O70137 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alx3O70137 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alx3O70137 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alx3O70137 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alx3O70137 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Alx3O70137 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alx3O70137 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms