Protein–RNA interactions for Protein: O55226

Chad, Chondroadherin, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChadO55226 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChadO55226 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChadO55226 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChadO55226 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChadO55226 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChadO55226 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChadO55226 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ChadO55226 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChadO55226 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChadO55226 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ChadO55226 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChadO55226 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ChadO55226 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChadO55226 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ChadO55226 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ChadO55226 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChadO55226 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChadO55226 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChadO55226 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChadO55226 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ChadO55226 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ChadO55226 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ChadO55226 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ChadO55226 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ChadO55226 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChadO55226 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChadO55226 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChadO55226 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChadO55226 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChadO55226 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChadO55226 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ChadO55226 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChadO55226 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChadO55226 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChadO55226 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChadO55226 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChadO55226 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ChadO55226 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChadO55226 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChadO55226 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChadO55226 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ChadO55226 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChadO55226 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChadO55226 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChadO55226 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ChadO55226 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChadO55226 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChadO55226 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChadO55226 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChadO55226 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChadO55226 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChadO55226 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChadO55226 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChadO55226 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChadO55226 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChadO55226 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChadO55226 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChadO55226 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChadO55226 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChadO55226 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChadO55226 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChadO55226 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChadO55226 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChadO55226 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChadO55226 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChadO55226 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChadO55226 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChadO55226 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChadO55226 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChadO55226 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChadO55226 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChadO55226 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChadO55226 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ChadO55226 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChadO55226 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChadO55226 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChadO55226 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChadO55226 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChadO55226 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChadO55226 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChadO55226 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ChadO55226 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChadO55226 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChadO55226 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChadO55226 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChadO55226 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChadO55226 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChadO55226 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ChadO55226 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChadO55226 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChadO55226 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChadO55226 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChadO55226 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChadO55226 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChadO55226 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChadO55226 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChadO55226 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChadO55226 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChadO55226 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChadO55226 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms