Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cbx4O55187 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.1 ms