Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Atp2a2O55143 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp2a2O55143 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms