Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nipsnap2O55126 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nipsnap2O55126 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms