Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PrxO55103 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrxO55103 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrxO55103 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrxO55103 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrxO55103 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrxO55103 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PrxO55103 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PrxO55103 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PrxO55103 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PrxO55103 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PrxO55103 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PrxO55103 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PrxO55103 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PrxO55103 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PrxO55103 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PrxO55103 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PrxO55103 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PrxO55103 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PrxO55103 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PrxO55103 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PrxO55103 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PrxO55103 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PrxO55103 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrxO55103 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrxO55103 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrxO55103 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrxO55103 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrxO55103 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrxO55103 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrxO55103 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrxO55103 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrxO55103 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrxO55103 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrxO55103 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrxO55103 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrxO55103 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrxO55103 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrxO55103 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrxO55103 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrxO55103 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrxO55103 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrxO55103 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrxO55103 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrxO55103 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrxO55103 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrxO55103 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrxO55103 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrxO55103 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrxO55103 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrxO55103 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrxO55103 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrxO55103 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrxO55103 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrxO55103 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrxO55103 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrxO55103 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PrxO55103 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrxO55103 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrxO55103 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrxO55103 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrxO55103 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrxO55103 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrxO55103 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrxO55103 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrxO55103 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrxO55103 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PrxO55103 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrxO55103 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrxO55103 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrxO55103 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PrxO55103 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PrxO55103 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PrxO55103 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PrxO55103 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PrxO55103 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PrxO55103 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PrxO55103 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PrxO55103 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PrxO55103 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PrxO55103 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PrxO55103 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PrxO55103 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PrxO55103 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PrxO55103 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PrxO55103 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PrxO55103 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PrxO55103 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PrxO55103 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PrxO55103 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PrxO55103 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PrxO55103 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PrxO55103 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PrxO55103 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PrxO55103 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PrxO55103 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PrxO55103 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PrxO55103 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PrxO55103 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PrxO55103 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms