Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Trappc3O55013 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc3O55013 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms