Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn5O54942 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn5O54942 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn5O54942 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn5O54942 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn5O54942 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn5O54942 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn5O54942 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn5O54942 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn5O54942 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn5O54942 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn5O54942 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn5O54942 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn5O54942 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn5O54942 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn5O54942 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn5O54942 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn5O54942 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn5O54942 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn5O54942 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn5O54942 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn5O54942 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn5O54942 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn5O54942 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn5O54942 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn5O54942 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn5O54942 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn5O54942 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn5O54942 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn5O54942 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn5O54942 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn5O54942 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn5O54942 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn5O54942 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn5O54942 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn5O54942 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn5O54942 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn5O54942 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn5O54942 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn5O54942 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn5O54942 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn5O54942 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn5O54942 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn5O54942 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn5O54942 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn5O54942 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn5O54942 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn5O54942 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn5O54942 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cldn5O54942 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cldn5O54942 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cldn5O54942 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cldn5O54942 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn5O54942 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn5O54942 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn5O54942 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn5O54942 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn5O54942 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn5O54942 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn5O54942 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn5O54942 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn5O54942 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn5O54942 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn5O54942 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn5O54942 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn5O54942 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn5O54942 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn5O54942 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn5O54942 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn5O54942 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn5O54942 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn5O54942 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn5O54942 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn5O54942 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn5O54942 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn5O54942 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn5O54942 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cldn5O54942 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn5O54942 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn5O54942 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn5O54942 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn5O54942 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn5O54942 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn5O54942 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn5O54942 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn5O54942 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn5O54942 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn5O54942 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn5O54942 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn5O54942 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn5O54942 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn5O54942 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn5O54942 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn5O54942 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn5O54942 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn5O54942 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn5O54942 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn5O54942 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn5O54942 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn5O54942 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms