Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pik3cdO35904 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pik3cdO35904 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pik3cdO35904 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pik3cdO35904 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pik3cdO35904 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pik3cdO35904 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Pik3cdO35904 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pik3cdO35904 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pik3cdO35904 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pik3cdO35904 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pik3cdO35904 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pik3cdO35904 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pik3cdO35904 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pik3cdO35904 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pik3cdO35904 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pik3cdO35904 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pik3cdO35904 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pik3cdO35904 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pik3cdO35904 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pik3cdO35904 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pik3cdO35904 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pik3cdO35904 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pik3cdO35904 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pik3cdO35904 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pik3cdO35904 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pik3cdO35904 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pik3cdO35904 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pik3cdO35904 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pik3cdO35904 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pik3cdO35904 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pik3cdO35904 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pik3cdO35904 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pik3cdO35904 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pik3cdO35904 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pik3cdO35904 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pik3cdO35904 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pik3cdO35904 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pik3cdO35904 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pik3cdO35904 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pik3cdO35904 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pik3cdO35904 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pik3cdO35904 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pik3cdO35904 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Pik3cdO35904 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pik3cdO35904 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Pik3cdO35904 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Pik3cdO35904 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pik3cdO35904 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pik3cdO35904 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pik3cdO35904 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pik3cdO35904 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pik3cdO35904 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pik3cdO35904 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pik3cdO35904 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pik3cdO35904 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pik3cdO35904 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pik3cdO35904 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pik3cdO35904 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pik3cdO35904 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pik3cdO35904 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pik3cdO35904 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pik3cdO35904 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pik3cdO35904 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pik3cdO35904 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pik3cdO35904 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pik3cdO35904 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pik3cdO35904 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pik3cdO35904 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pik3cdO35904 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pik3cdO35904 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pik3cdO35904 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pik3cdO35904 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pik3cdO35904 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pik3cdO35904 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pik3cdO35904 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pik3cdO35904 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pik3cdO35904 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pik3cdO35904 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pik3cdO35904 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pik3cdO35904 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pik3cdO35904 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pik3cdO35904 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pik3cdO35904 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pik3cdO35904 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pik3cdO35904 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pik3cdO35904 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pik3cdO35904 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pik3cdO35904 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pik3cdO35904 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pik3cdO35904 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pik3cdO35904 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pik3cdO35904 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pik3cdO35904 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pik3cdO35904 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pik3cdO35904 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pik3cdO35904 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pik3cdO35904 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Pik3cdO35904 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Pik3cdO35904 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms