Protein–RNA interactions for Protein: O35457

Ccrl2, C-C chemokine receptor-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccrl2O35457 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccrl2O35457 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccrl2O35457 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms