Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TnxbO35452 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TnxbO35452 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TnxbO35452 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TnxbO35452 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TnxbO35452 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TnxbO35452 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TnxbO35452 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TnxbO35452 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TnxbO35452 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TnxbO35452 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TnxbO35452 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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TnxbO35452 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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TnxbO35452 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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TnxbO35452 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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TnxbO35452 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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TnxbO35452 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
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TnxbO35452 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
TnxbO35452 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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TnxbO35452 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TnxbO35452 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TnxbO35452 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TnxbO35452 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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TnxbO35452 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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TnxbO35452 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TnxbO35452 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TnxbO35452 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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TnxbO35452 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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TnxbO35452 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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TnxbO35452 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TnxbO35452 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TnxbO35452 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TnxbO35452 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TnxbO35452 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TnxbO35452 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
TnxbO35452 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TnxbO35452 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TnxbO35452 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TnxbO35452 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TnxbO35452 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TnxbO35452 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TnxbO35452 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TnxbO35452 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TnxbO35452 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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TnxbO35452 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
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