Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Xbp1O35426 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Xbp1O35426 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms