Protein–RNA interactions for Protein: O35348

Colq, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, mousemouse

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Length 457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ColqO35348 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ColqO35348 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ColqO35348 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ColqO35348 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ColqO35348 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ColqO35348 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ColqO35348 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ColqO35348 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ColqO35348 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ColqO35348 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ColqO35348 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ColqO35348 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ColqO35348 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ColqO35348 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ColqO35348 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ColqO35348 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ColqO35348 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ColqO35348 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ColqO35348 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ColqO35348 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ColqO35348 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ColqO35348 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ColqO35348 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ColqO35348 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ColqO35348 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ColqO35348 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ColqO35348 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ColqO35348 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ColqO35348 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ColqO35348 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ColqO35348 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ColqO35348 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ColqO35348 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ColqO35348 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ColqO35348 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ColqO35348 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ColqO35348 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ColqO35348 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ColqO35348 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ColqO35348 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ColqO35348 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ColqO35348 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ColqO35348 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ColqO35348 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ColqO35348 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ColqO35348 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ColqO35348 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ColqO35348 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ColqO35348 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ColqO35348 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ColqO35348 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ColqO35348 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ColqO35348 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ColqO35348 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ColqO35348 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ColqO35348 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ColqO35348 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ColqO35348 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ColqO35348 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ColqO35348 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ColqO35348 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ColqO35348 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ColqO35348 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ColqO35348 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ColqO35348 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ColqO35348 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ColqO35348 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ColqO35348 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ColqO35348 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ColqO35348 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ColqO35348 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ColqO35348 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ColqO35348 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ColqO35348 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ColqO35348 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ColqO35348 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ColqO35348 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ColqO35348 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ColqO35348 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ColqO35348 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ColqO35348 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ColqO35348 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ColqO35348 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ColqO35348 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ColqO35348 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ColqO35348 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ColqO35348 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ColqO35348 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ColqO35348 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ColqO35348 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ColqO35348 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ColqO35348 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ColqO35348 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ColqO35348 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ColqO35348 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ColqO35348 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ColqO35348 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ColqO35348 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ColqO35348 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ColqO35348 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms