Protein–RNA interactions for Protein: O35253

Smad7, Mothers against decapentaplegic homolog 7, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad7O35253 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smad7O35253 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smad7O35253 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smad7O35253 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smad7O35253 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smad7O35253 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smad7O35253 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smad7O35253 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smad7O35253 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smad7O35253 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smad7O35253 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smad7O35253 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smad7O35253 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smad7O35253 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smad7O35253 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smad7O35253 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smad7O35253 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smad7O35253 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smad7O35253 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smad7O35253 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Smad7O35253 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smad7O35253 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smad7O35253 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smad7O35253 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Smad7O35253 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Smad7O35253 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smad7O35253 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smad7O35253 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smad7O35253 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smad7O35253 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smad7O35253 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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