Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pitx3O35160 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms