Protein–RNA interactions for Protein: O08790

Fpr-s1, Formyl peptide receptor-related sequence 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fpr-s1O08790 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Fpr-s1O08790 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
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Fpr-s1O08790 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fpr-s1O08790 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fpr-s1O08790 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fpr-s1O08790 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Fpr-s1O08790 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fpr-s1O08790 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Fpr-s1O08790 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Fpr-s1O08790 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fpr-s1O08790 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fpr-s1O08790 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fpr-s1O08790 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fpr-s1O08790 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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Fpr-s1O08790 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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Fpr-s1O08790 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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Fpr-s1O08790 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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Fpr-s1O08790 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Fpr-s1O08790 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fpr-s1O08790 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Fpr-s1O08790 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Fpr-s1O08790 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Fpr-s1O08790 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fpr-s1O08790 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Fpr-s1O08790 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fpr-s1O08790 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fpr-s1O08790 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fpr-s1O08790 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fpr-s1O08790 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fpr-s1O08790 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fpr-s1O08790 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Fpr-s1O08790 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fpr-s1O08790 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fpr-s1O08790 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fpr-s1O08790 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fpr-s1O08790 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fpr-s1O08790 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fpr-s1O08790 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fpr-s1O08790 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fpr-s1O08790 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fpr-s1O08790 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fpr-s1O08790 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Fpr-s1O08790 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fpr-s1O08790 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fpr-s1O08790 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fpr-s1O08790 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Fpr-s1O08790 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fpr-s1O08790 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fpr-s1O08790 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fpr-s1O08790 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms