Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D2

Gm3278, Predicted gene 3278, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3278L7N2D2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3278L7N2D2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3278L7N2D2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3278L7N2D2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3278L7N2D2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3278L7N2D2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3278L7N2D2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3278L7N2D2 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3278L7N2D2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3278L7N2D2 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3278L7N2D2 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3278L7N2D2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3278L7N2D2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3278L7N2D2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3278L7N2D2 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3278L7N2D2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm3278L7N2D2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm3278L7N2D2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm3278L7N2D2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm3278L7N2D2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm3278L7N2D2 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm3278L7N2D2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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Gm3278L7N2D2 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3278L7N2D2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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