Protein–RNA interactions for Protein: L7N232

Zfp955b, Zinc finger protein 955B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp955bL7N232 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp955bL7N232 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp955bL7N232 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp955bL7N232 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp955bL7N232 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp955bL7N232 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp955bL7N232 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp955bL7N232 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Zfp955bL7N232 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp955bL7N232 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp955bL7N232 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp955bL7N232 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp955bL7N232 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp955bL7N232 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp955bL7N232 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp955bL7N232 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp955bL7N232 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp955bL7N232 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp955bL7N232 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp955bL7N232 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp955bL7N232 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp955bL7N232 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp955bL7N232 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp955bL7N232 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zfp955bL7N232 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp955bL7N232 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp955bL7N232 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp955bL7N232 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp955bL7N232 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp955bL7N232 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp955bL7N232 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp955bL7N232 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp955bL7N232 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp955bL7N232 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp955bL7N232 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp955bL7N232 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp955bL7N232 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp955bL7N232 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp955bL7N232 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp955bL7N232 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp955bL7N232 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp955bL7N232 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp955bL7N232 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp955bL7N232 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp955bL7N232 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp955bL7N232 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp955bL7N232 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp955bL7N232 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp955bL7N232 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp955bL7N232 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp955bL7N232 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp955bL7N232 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp955bL7N232 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp955bL7N232 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp955bL7N232 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp955bL7N232 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp955bL7N232 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp955bL7N232 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Zfp955bL7N232 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zfp955bL7N232 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zfp955bL7N232 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Zfp955bL7N232 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Zfp955bL7N232 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zfp955bL7N232 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zfp955bL7N232 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp955bL7N232 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp955bL7N232 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp955bL7N232 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp955bL7N232 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp955bL7N232 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp955bL7N232 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp955bL7N232 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp955bL7N232 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp955bL7N232 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zfp955bL7N232 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp955bL7N232 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zfp955bL7N232 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp955bL7N232 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp955bL7N232 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp955bL7N232 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp955bL7N232 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zfp955bL7N232 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zfp955bL7N232 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp955bL7N232 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp955bL7N232 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp955bL7N232 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp955bL7N232 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp955bL7N232 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp955bL7N232 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp955bL7N232 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp955bL7N232 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp955bL7N232 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp955bL7N232 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp955bL7N232 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp955bL7N232 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp955bL7N232 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp955bL7N232 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp955bL7N232 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp955bL7N232 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp955bL7N232 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms