Protein–RNA interactions for Protein: L7N1Z3

Vmn1r80, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r80L7N1Z3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r80L7N1Z3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r80L7N1Z3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r80L7N1Z3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r80L7N1Z3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r80L7N1Z3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r80L7N1Z3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r80L7N1Z3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r80L7N1Z3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r80L7N1Z3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r80L7N1Z3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r80L7N1Z3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r80L7N1Z3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.8 ms