Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21900J3QP38 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21900J3QP38 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21900J3QP38 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21900J3QP38 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21900J3QP38 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21900J3QP38 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21900J3QP38 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21900J3QP38 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21900J3QP38 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21900J3QP38 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm21900J3QP38 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21900J3QP38 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21900J3QP38 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21900J3QP38 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21900J3QP38 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21900J3QP38 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21900J3QP38 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21900J3QP38 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21900J3QP38 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21900J3QP38 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21900J3QP38 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21900J3QP38 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21900J3QP38 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21900J3QP38 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21900J3QP38 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21900J3QP38 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21900J3QP38 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21900J3QP38 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21900J3QP38 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21900J3QP38 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21900J3QP38 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21900J3QP38 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21900J3QP38 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21900J3QP38 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21900J3QP38 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21900J3QP38 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21900J3QP38 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21900J3QP38 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21900J3QP38 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21900J3QP38 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21900J3QP38 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21900J3QP38 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21900J3QP38 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21900J3QP38 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm21900J3QP38 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21900J3QP38 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21900J3QP38 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21900J3QP38 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21900J3QP38 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21900J3QP38 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21900J3QP38 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21900J3QP38 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21900J3QP38 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21900J3QP38 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21900J3QP38 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21900J3QP38 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21900J3QP38 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21900J3QP38 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21900J3QP38 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21900J3QP38 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21900J3QP38 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21900J3QP38 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm21900J3QP38 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21900J3QP38 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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