Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm21976J3QNN2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm21976J3QNN2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm21976J3QNN2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm21976J3QNN2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm21976J3QNN2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
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Gm21976J3QNN2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm21976J3QNN2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm21976J3QNN2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm21976J3QNN2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm21976J3QNN2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm21976J3QNN2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm21976J3QNN2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm21976J3QNN2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm21976J3QNN2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm21976J3QNN2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm21976J3QNN2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm21976J3QNN2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm21976J3QNN2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm21976J3QNN2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm21976J3QNN2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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Gm21976J3QNN2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm21976J3QNN2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm21976J3QNN2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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Gm21976J3QNN2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm21976J3QNN2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm21976J3QNN2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm21976J3QNN2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm21976J3QNN2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm21976J3QNN2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm21976J3QNN2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm21976J3QNN2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Gm21976J3QNN2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Gm21976J3QNN2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Gm21976J3QNN2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm21976J3QNN2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm21976J3QNN2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm21976J3QNN2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm21976J3QNN2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Gm21976J3QNN2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm21976J3QNN2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm21976J3QNN2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm21976J3QNN2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm21976J3QNN2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm21976J3QNN2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm21976J3QNN2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm21976J3QNN2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm21976J3QNN2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm21976J3QNN2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm21976J3QNN2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm21976J3QNN2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm21976J3QNN2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm21976J3QNN2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm21976J3QNN2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm21976J3QNN2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm21976J3QNN2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Gm21976J3QNN2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Gm21976J3QNN2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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