Protein–RNA interactions for Protein: J3QME6

Lipo1, Lipase, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lipo1J3QME6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lipo1J3QME6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lipo1J3QME6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lipo1J3QME6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lipo1J3QME6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lipo1J3QME6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lipo1J3QME6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lipo1J3QME6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lipo1J3QME6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lipo1J3QME6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lipo1J3QME6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lipo1J3QME6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lipo1J3QME6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lipo1J3QME6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lipo1J3QME6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
Lipo1J3QME6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Lipo1J3QME6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms