Protein–RNA interactions for Protein: J3QME2

Gm20914, Predicted gene, 20914, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20914J3QME2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20914J3QME2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms