Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930544D05RikJ3QK56 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930544D05RikJ3QK56 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms